LICENSE
MANIFEST.in
README.md
pyproject.toml
setup.cfg
setup.py
.github/workflows/python-package.yml
.github/workflows/python-publish.yml
iseq_prof/__init__.py
iseq_prof/_accession.py
iseq_prof/_cache.py
iseq_prof/_confusion.py
iseq_prof/_file.py
iseq_prof/_genbank.py
iseq_prof/_gff.py
iseq_prof/_hmmer_reader.py
iseq_prof/_organism_result.py
iseq_prof/_profiling.py
iseq_prof/_strdb.py
iseq_prof/_tables.py
iseq_prof/_testit.py
iseq_prof/_version.py
iseq_prof/fasta.py
iseq_prof/filedb.py
iseq_prof/osolut_space.py
iseq_prof/pfam.py
iseq_prof/sam.py
iseq_prof/solut_space.py
iseq_prof.egg-info/PKG-INFO
iseq_prof.egg-info/SOURCES.txt
iseq_prof.egg-info/dependency_links.txt
iseq_prof.egg-info/entry_points.txt
iseq_prof.egg-info/requires.txt
iseq_prof.egg-info/top_level.txt
iseq_prof.egg-info/zip-safe
iseq_prof/_cli/__init__.py
iseq_prof/_cli/_cli.py
iseq_prof/_cli/_compute_clans.py
iseq_prof/_cli/_hmm_filter.py
iseq_prof/_cli/_info_fail.py
iseq_prof/_cli/_merge_chunks.py
iseq_prof/_cli/_merge_scores.py
iseq_prof/_cli/_plot_acc_eeplot.py
iseq_prof/_cli/_plot_align.py
iseq_prof/_cli/_plot_eeplot.py
iseq_prof/_cli/_plot_overall_ss.py
iseq_prof/_cli/_plot_prof_hits.py
iseq_prof/_cli/_plot_roc.py
iseq_prof/_cli/_plot_scores.py
iseq_prof/_cli/_progress.py
iseq_prof/_cli/_util.py
iseq_prof/plot/__init__.py
iseq_prof/plot/_align.py
iseq_prof/plot/_evalue.py
iseq_prof/plot/_roc.py
iseq_prof/plot/_scores.py
iseq_prof/test/__init__.py
iseq_prof/test/test_accession.py
iseq_prof/test/test_confusion_matrix.py
iseq_prof/test/test_fasta.py
iseq_prof/test/test_genbank.py
iseq_prof/test/test_pfam.py
iseq_prof/test/test_prof_acc.py
iseq_prof/test/test_profiling.py
script/README.md
script/build-genbank-catalog.py